В 1988-1993 годах разработаны элементы теории построения аппаратно-программных комплексов для подготовки и принятия решений в области организационного управления.
В 1989-1998 годах созданы основы нового научного направления - теории живучести информационно-вычислительных систем и сетей. Получили развитие научно-технические и опытно-конструкторские работы по созданию распределенных вычислительных систем и сетей повышенной живучести, фундаментальные исследования по теории живучести.
Разработаны комплекс технических средств для передачи информации в компьютерном виде по телевизионной сети, компьютерная система управления тренажно-моделирующим комплексом Центра подготовки космонавтов им. Ю. А. Гагарина. Разработанные методы структурной организации и кeрування для информационно-вычислительной системы на основе комплекса средств долговременного хранения информации. Созданные i работают информационно-вычислительная система управления повседневной деятельностью авiапiдприемства, автоматизированная информационная система управления повседневной деятельностью Штаба вооружения Вооруженных Сил Украины. Разработаны концепция и системный проект создания Правительственной информационно-аналитической системы по вопросам чрезвычайных ситуаций, внедрена первая очередь этой системы.

Сейчас научный коллектив разрабатывает принципы и методологические основы построения многоуровневых информационно-вычислительных систем для решения задач управления процессами и об "ектами в иерархических структурах.
Совместно со специалистами НАИ и ДК ТЗИ разрабатывается проблема обеспечения информационной безопасности компьютерный пространства Украины. Создана концепция информационной безопасности Украины, которая должна стать основой для систематизации вопросов, которые объединены в проблему обеспечения информационной безопасности Украины. Она определяет методы и средства защиты жизненно важных интересов личности, общества, государства в информационной сфере, станет основой для формирования государственной политики информационной безопасности, для создания и развития информационного пространства государства.
В 1991 году впервые в мире разработаны концепция, технология и образцы оборудования системы массового распространения компьютерной информации по каналам широковещательного телевидения и состоялась презентация электронной компьютерной газеты "Все-Всем". Эта система, разработчиками которой являются член-корр. НАН Украины В. В. Петров, д.т.н. А. Г. Додонов, к.т.н. В. Я. Сандул и к.т.н. А. В. Нестеренко, не имеет мировых аналогов и признана Держпатентом Украины лучшим изобретением 1993 года.

Она включала в себя электронную компьютерную газету "Все-Всем", главную и тематические редакции компьютерной информации, центр компьютерной информации, который осуществляет обмен информацией с отечественными и зарубежными центрами. Важность использования технических возможностей этой системы была отмечена в постановлении Президиума НАН Украины от 15.11.93р. № 317 и распоряжении Кабинета Министров Украины от 04.03.96р. № 157-р. Особенно важно было использование этой системы для ускорения информатизации Государственной налоговой администрации Украины, которая в 1994-1995гг. установила в своих 571 подразделениях рабочие места электронной газеты и осуществляла оперативное распространение баз данных реестров юридических и физических лиц, программных продуктов и другой служебной информации.
В 1996 году под руководством член.кор. НАН Украины Петрова В.В. впервые в мире разработан прямой оптико-механический метод перезаписи фонографических цилиндров Эдисона, который позволяет воспроизвести звук с помощью лазерного интерферометра без повреждения цилиндров. Это дает возможность восстановить уникальные старинные звуковые записи с высоким качеством и организовать систематическую работу по перезаписи и хранения в компьютерном виде фонографической достояние культурного наследия Украины.

При использовании этого метода был изготовлен оптический диск с редкими записями с фоноархиву еврейских этнографических материалов, хранящихся в Украине в Национальной библиотеке им. В. И. Вернадского. Первый оптический диск был подарен президенту Израиля Президентом Украины во время его визита в Израиль в ноябре 1996 года. Эти результаты были отмечены в постановлении Президиума НАН Украины от 03.04.96р. № 122. Во исполнение распоряжения Президента Украины от 6 февраля 1997 институтом организован выпуск компакт-дисков с уникальными записями еврейской музыкального творчества из фондов Национальной библиотеки Украины им.В. И. Вернадского и планируется их распространение на коммерческой основе среди еврейского населения стран мира.
В конце 70-х годов под руководством д.т.н. Синькова М.В.розроблени новые численные методы решения систем интегральных уравнений згорточного типа больших размеров. Эти исследования являются основой разработки отечественного рентгеновского компьютерного томографа третьего поколения.

Пройденный путь - это путь становления института, значительных достижений ученых, создания и развития научных школ и новых научных направлений в информационных технологиях.

За цикл работ "Физические методы и компьютерные средства регистрации, хранения и использования больших объемов информации" сотрудникам института В. В. Петрову, А. А. Крючин, С. М. Шанойло, М. В. Синьков, В.И. Кожешкурту, И. В. Косяк была присуждена Государственная премия Украины в области науки и техники за 2008 год.
Сегодня в состав Института проблем регистрации информации входят шесть научно-исследовательских и три научно-технических отделах, а также Ужгородский научно-технологический центр материалов оптических носителей информации (на правах юридического лица).
В институте работает 240 человек, в том числе 82 научных сотрудника, среди них 2 члена-корреспондента НАН Украины, 8 докторов наук, 22 кандидата наук.
Основными направлениями научной деятельности, утвержденными постановлением Президиума НАН Украины от 8.06.2005 № 117, являются:
- Физические основы, принципы, методы и системы оптической регистрации информации. Создание технологии долговременного хранения цифровой информации;

- Теоретические основы и прикладные методы создания компьютерных информационно-аналитических систем, исследование и разработка методов защиты информации в компьютерных системах и сетях. Методы и системы поддержки принятия решений;
- Разработка методов и создание системы компьютерных сетей банков и баз данных и знаний, систем массового распространения компьютерной информации;
- Создание систем воспроизведения звука и изображений с раритетных носителей информации, систем регистрации информации неразрушающими и томографических методов.
Институт является учредителем и издателем "Украинского реферативного журнала" Джерело "(1995 год, с 1999 года издается совместно с Национальной библиотекой Украины им. В. И. Вернадского) и научно-технического журнала "Регистрация, хранение и обработка данных" (1998 год), сборника научных трудов "Информационные технологии и безопасность" (2000 год).